网站地图
rDNA

rDNA,即核糖体DNA。rDNA 就是可以转录产生rRNA的基因,rDNA的活性改变在核仁周期(也就是细胞分裂过程中核仁的消失与重建)中发挥着重要作用。它不是单独存在的,有时候它可以和别的基因间隔分布,比如可以和tDNA间隔。

rDNA是编码核糖体RNA的基因,其测定序列常用来鉴定物种同源性,和鉴别物种可以通过PCR技术和荧光染色技术结合准确定位基因位置。核糖体被誉为“细胞的蛋白质工厂”,rDNA所编码的蛋白质就是核糖体蛋白。在普通的细胞中,存在着超过100个rDNA重复序列,而且它们相当不稳定。这些重复序列彼此之间很容易发生重组,而在人体内,这种重组若发生在其他DNA序列上则会导致多种疾病(例如,癌症和亨廷顿舞蹈症)。核糖体内不存在DNA。rDNA是指核DNA中编码核糖体蛋白的DNA序列,只是长链DNA序列中的一段,不存在一条DNA序列只编码核糖体蛋白。所以rDNA是不会单独存在的。

rRNA一般存在于细胞核的核仁组织区,在转录完毕后结合成核糖体的大小两个亚基并在细胞质中与mRNA结合形成核糖体。在叶绿体和线粒体里也有部分rRNA。

随着生物技术的飞速发展, 传统的微生物鉴定方法常常难以鉴定众多的生长习性复杂的微生物,因而基于基因组序列的分子鉴定受到广泛关注。在细菌基因组中, 编码 16S rRNA 的 rDNA 基因具有良好的进化保守性,适宜分析的长度( 约为 1 5kb), 以及与进化距离相匹配的良好变异性,所以成为细菌分子鉴定的标准标识序列。目前16SrDNA的序列信息已经广泛应用于菌种鉴定和系统发生学研究。

根据细菌的16S rDNA 3'端和23S rDNA 5'端的高度保守区设计引物,PCR扩增了2株创伤弧菌(Vibrio vulnificus)的16S-23S rDNA间区(Intergenic spacer,IGS),克隆到pGEM-T载体上。测序是用BLAST和DNAstar软件对16S-23SrDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析。结果表明,2株创伤弧菌共测出9条16S-23S rDNA间区序列,其中ZSU006测出5条,间区类型分别为:IGSGLAV、IGSGLV、IGSIA、IGSA和IGSG.其中IGSGLAV最大,包含tRNAGlu、tRNALys、tRNAAla和tRNAVal基因;IGSGLV包含tRNAGlu、tRNALys和tRNAVal基因;IGSIn,则包含tRNAIle和tRNAAla基因;IGSG仅包含tRNAGlu基因;而IGSA仅包含tRNAAla基因。菌株CG021测出的16S-23S rDNAIGS序列有4条,除缺少IGSA外,其余的IGS类型均与ZSU006的相同。与GenBank内的创伤弧菌ATCC27562的IGS序列比较,发现创伤弧菌所有类型的IGS的tRNA基因两端的非编码区具有较高的种内同源性。16S-23S rDNA间区结构的差异为建立一种新的创伤弧菌检测方法奠定了基础。

采用CPD(PI和DAPI组合)染色对番茄减数分裂粗线期和有丝分裂中期染色体进行了显带分析,随后用两种不同的45S rDNA 克隆在相同的分裂相进行了荧光原位杂交定位分析。CPD 染色在8条粗线期染色体上显示出了10条红色的CPD 带纹,在6对有丝分裂中期染色体上显示出了12条CPD带纹。有丝分裂中期染色体上的CPD带纹与粗线期染色体上显要的带纹具有对应性。用改良的CPD染色程序清晰而稳定地显示出的这些特征性的CPD带纹,为番茄的染色体,特别是有丝分裂中期染色体提供了新的识别标记。用番茄的一个45S rDNA 克隆进行的荧光原位杂交,不仅在位于2号染色体短臂的随体上显示了强的杂交信号,而且在粗线期染色体的5个CPD带区或有丝分裂中期染色体的4对CPD带区显示了弱的杂交信号。然而,用来自小麦的45S rDNA 克隆 pTa71进行的原位杂交却只在随体上显示了杂交信号。鉴于所用的两个45S rDNA 克隆在序列上的差异,推断在番茄基因组中只有随体含有45S rDNA 单位的编码区,即番茄只有一对45S rDNA位点。

结构基因(structural gene)是指某些能决定某种多肽链(蛋白质)或酶分子结构的基因。结构基因的突变可导致特定蛋白质(或酶)一级结构的改变或影响蛋白质(或酶)量的改变。

调控基因(regulator and control gene)是指某些可调节控制结构基因表达的基因。调控基因的突变可以影响一个或多个结构基因的功能,或导致一个或多个蛋白质(或酶)时的改变。

此外,还有一些只转录而不翻译的基因,如核糖体RNA基因(ribosomal RNA gene),也称为rDNA基因,它们专门转录rRNA;还有转运RNA基因(transfer RNA gene),也称为tRNA基因,是专门转录tRNA的。


相关文章推荐:
核糖体DNA | 转录 | 基因 | 核仁周期 | 细胞分裂 | 核仁 | rDNA | 核仁周期 | 细胞核 | 核仁组织区 | RNA | 基因 | 同源性 | 核糖体 | 核糖体蛋白 | 重复序列 | DNA序列 | 亨廷顿舞蹈症 | 核糖 | 核仁组织区 | 转录 | 核糖体 | mRNA | 叶绿体 | 线粒体 | 分子鉴定 | 基因组 | 保守性 | 16SrDNA | 菌种鉴定 | 系统发生学 | PCR扩增 | 创伤弧菌 | IGS | BLAST | IGS | GenBank | 非编码区 | 同源性 | DAPI | 减数分裂 | 粗线期 | 有丝分裂 | 荧光原位杂交 | 有丝分裂 | 原位杂交 | 2号染色体 | 随体 | 粗线期 | 基因组 | 编码区 | 结构基因 | 基因 | 基因表达 | 转录 | 核糖体RNA基因 | RNA | tRNA |
相关词汇词典